Фамилия Конджакулян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян (в диалектах и дореволюционной записи — -янц). Этот суффикс означает «из рода» или «потомок такого-то». Основа фамилии — личное прозвище или имя Конджакул, которое само по себе составное.

В основе Конджакул лежат два тюркских слова: «конджа» (в тюркских языках — «шишка», «почка», «молодой побег», а также переносно «видный, знатный человек») и «кул» («раб», «слуга»). В тюркской ономастике компонент «кул» часто входил в состав личных имен с пожелательным значением: «слуга Божий», «раб такого-то». Таким образом, Конджакул можно перевести как «слуга знатного господина» или, по другой версии, как «раб (Божий) по имени Конджа».

Фамилия характерна для армян, исторически живших в Западной Армении и на территории современной Турции, а также для армянских общин, расселившихся по Российской империи после геноцида 1915 года. Встречаются варианты написания: Конджакулов (русифицированная форма с суффиксом -ов), Конджагюлян, Гонджакулян. Изначально фамилия указывала на принадлежность к роду некоего Конджакула — человека, носившего прозвище, связанное либо с внешностью (например, «шишка» — человек с шишкой или выпуклостью), либо с социальным статусом (знатный слуга). Точную этимологию без знания конкретного диалекта установить сложно, но тюркский след в основе очевиден, а армянский суффикс закрепил фамилию в национальной традиции.