Фамилия Конопченко — характерный пример украинской модели фамилии на -енко. Этот суффикс, особенно распространённый в Левобережной Украине, изначально означал «сын» или «потомок»: Конопченко — буквально «сын Конопки». Основа здесь — прозвище Конопка, а оно, в свою очередь, образовано от слова «конопля». В народе так могли назвать человека за светлые, «конопляные» волосы, за привычку сеять коноплю или за то, что он был высоким и тонким, как стебель. Иногда прозвище давали по занятию — крестьянину, который выращивал коноплю на волокно и масло.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «конопатить» (затыкать щели). В этом случае Конопка могло быть прозвищем плотника или конопатчика. Однако для русского уха фамилия звучит как «конопляная», и именно растительное происхождение поддерживается большинством ономастов, включая общую логику украинской антропонимии.

Фамилия бытует в основном в центральных и восточных областях Украины, а также в прилегающих регионах России, куда она попала с переселенцами. Встречаются и однокоренные фамилии — Конопля, Коноплёв, Конопленко. При этом Конопченко — более редкая форма, чем, скажем, Конопленко, что говорит о её локальном происхождении: возможно, в конкретном селе или роду прозвище Конопка закрепилось настолько прочно, что дало начало отдельной ветви.

Сословно фамилия недвусмысленно указывает на крестьянское или казацкое происхождение. В реестрах запорожских казаков XVIII века встречаются прозвища от «конопли», но именно форма на -енко чаще фиксируется у потомков свободных селян и казачьей старшины, а не у крепостных. Так что предки современных Конопченко, скорее всего, были людьми вольными, хоть и небогатыми, чьё прозвище со временем стало фамильным знаком целого рода.