Фамилия Коомыцев — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по стандартной русской модели: к основе на -ц- добавляется суффикс -ев (а не -ов, потому что после мягкого или шипящего согласного пишется -ев). Суффикс -ц- в основе указывает либо на уменьшительную форму (Коомыц — от более длинного имени или прозвища), либо на принадлежность к чему-то (например, «сын Коомыца»). Само ядро — Коомыц — звучит как прозвище или вариант личного имени.

Скорее всего, Коомыц — это искажённое или диалектное произношение какого-то другого слова. Самая прямая версия: основа восходит к тюркскому слову «комус» или «кумыс» — кисломолочный напиток из кобыльего молока. В русских говорах и документах XVII–XVIII веков встречались прозвища Кумыз, Кумысов, а фамилия Коомыцев могла закрепиться за человеком, который делал или торговал кумысом. Переход «у» в «о» в безударном положении (кумы́с → ко́омыс) возможен в южнорусских или сибирских говорах, где оканье смешивалось с аканьем.

Менее вероятная, но допустимая версия — от антропонима Коома, который мог быть вариантом крестильного имени Косма (Кузьма) в местном произношении. Тогда Коомыцев означало бы «потомок Коомыца», а сам Коомыц — уменьшительное от Коома. Однако такая цепочка сложнее, и фамилии с суффиксом -ыц- от Кузьмы обычно выглядят как Кузьмицын, Кузмичев.

География фамилии узкая. В открытых источниках носители Коомыцева встречаются в основном в Курской и Белгородской областях, а также на юге России — там, где исторически были контакты с тюркскими народами и развито коневодство. Если предки носили прозвище от кумыса, они могли быть скотоводами, торговцами или просто людьми, получившими имя по роду занятий.

В написании фамилии обращает на себя внимание двойное «о» — Коомыцев, а не Комыцев. Это может быть как следствием диалектного произношения (растянутый гласный), так и ошибкой при записи в паспортном столе. В любом случае, корень один, и фамилия остаётся редким примером того, как бытовое слово или занятие закрепилось в русской фамильной системе.