Фамилия Кощжанов — редкий случай, когда на стыке двух языков образовалась форма, не сразу поддающаяся однозначному толкованию. На первый взгляд, перед нами типичная русская фамилия с патронимическим суффиксом -ов, указывающим на принадлежность («чей?» — Кощжанов). Но основа Кощжан- явно не славянская и не из привычного крестильного календаря. Здесь, скорее всего, мы имеем дело с тюркским корнем, адаптированным русским окончанием.

Самая прямая версия возводит фамилию к казахскому или ногайскому имени Кощжан (вариант — Кошжан). В тюркских языках «кош» (или «кож») часто связано с понятиями «кочевка», «временное жилье», «пара», а «жан» — «душа», «человек». Таким образом, имя Кощжан могло означать «душа кочевья» или «спутник», «попутчик». В исламизированной среде этот компонент мог переосмысляться как «дорогой, как душа» — ласкательное прозвище. Русский суффикс -ов присоединился к полной форме имени, как это часто делали при оформлении фамилий у крещёных или обрусевших татар, башкир, казахов.

Не исключена и более прозаичная основа — от прозвища Кощжан, данного человеку с особым отношением к кочевому быту или же скотоводу, который постоянно перегонял скот («кош» — стоянка, временный лагерь). В таком случае фамилия указывает на род занятий предка, а не на личное имя. Встречается фамилия в основном в Оренбургской области, Башкортостане и среди казахстанских русских — именно в зоне активных тюрко-славянских контактов.

Интересно, что в русской записи фамилия сохранила глухой звук «щ», хотя в оригинале чаще звучит «ш» (Кошжанов). Это могло возникнуть из-за особенностей местного говора или при записи в церковных книгах, где писарь передал тюркский звук близким по акустике русским сочетанием «щ». В любом случае, Кощжанов — фамилия, чётко маркирующая географическое происхождение предков из пограничья степей и русского юго-востока.