Фамилия Кошницкий — вариант на -ский, что указывает на её географическое происхождение. В отличие от патронимических фамилий на -ов/-ин, такие фамилии обычно образовывались от названий населённых пунктов (ойконимов). Основа «Кошниц-» прямо отсылает к топониму Кошница или Кошницы. Такие названия встречаются в западнославянских землях: например, деревня Кошница (Košnica) есть в Словении и Хорватии, а в Польше и Беларуси известны поселения с похожими корнями. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был выходцем из места с таким именем — «тот, кто из Кошницы».

Корень «кош-» в славянских языках многозначен. В древнерусском «кошь» означало корзину, плетёную ёмкость, а также стан или лагерь. Отсюда «кошевой» — атаман, заведовавший общим котлом. В польском и чешском kosz — тоже корзина, а košnice — ульи. Поэтому Кошница могла быть и прозвищным названием поселения: место, где плели корзины, держали пчёл или стоял обоз. Однако для фамилии Кошницкий географическая версия остаётся основной, поскольку суффикс -ский в восточнославянской традиции почти всегда прикреплялся к названиям мест.

Суффикс -ц- в основе (Кошницкий, а не Кошников) указывает на то, что топоним был в форме прилагательного или уменьшительного: Кошница. Это типичная модель для фамилий шляхетского или мещанского происхождения в Речи Посполитой, где подобные фамилии на -ский носили дворяне, владевшие землёй в данной местности. В Российской империи фамилия могла закрепиться за духовенством или канцелярскими служащими, получившими её по месту рождения или службы. В крестьянской среде такие фамилии редки — там преобладали прозвищные и патронимические формы.

В написании фамилии возможна вариативность: в старых документах встречается «Кошницкий» и реже «Кошницький» (с мягким знаком, по украинской традиции). Ударение, скорее всего, падает на второй слог — КошнИцкий, что соответствует ударению в гипотетическом топониме. Родственные фамилии — Кошников, Кошнецкий, Кошанский — разошлись по разным моделям образования, но все восходят к тому же корню «кош».