Фамилия Котяткина образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей — от прозвища или имени через суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей сын?» — Котяткин. Основа здесь — «котёнок» или «котята». Но прямое значение «маленький кот» для прозвища маловероятно: вряд ли взрослого человека назвали бы детёнышем животного без ироничного или переносного смысла.

Куда правдоподобнее версия, что в основе лежит не зоологическое, а личное имя или прозвище Кот, Котя. В древнерусской традиции такие имена были нередки: Кот встречается в берестяных грамотах и писцовых книгах. От него образовывали уменьшительно-ласкательные формы Котятка, Котятко — так могли звать младшего сына или подростка. Фамилия Котяткин (а в женском роде Котяткина) буквально значит «потомок Котятки». Суффикс -ин, а не -ов, типичен для прозвищ на -а, -я, что тоже подтверждает эту цепочку.

Другая, менее очевидная гипотеза — связь с географическим названием. В русских говорах «котятка» иногда называли не только котёнка, но и вид рыболовной снасти или даже растение. Если предок жил в местности, где такое слово было в ходу, прозвище могло отражать его занятие или место жительства. Однако документальных подтверждений этой версии для фамилии Котяткина нет, и она уступает первой по простоте и типичности.

Фамилия редкая и не относится к числу дворянских. В дореволюционных переписях Котяткины встречаются преимущественно среди крестьян и мещан центральной России — в Тверской, Ярославской, Костромской губерниях. Встречаемость фамилии резко возрастает в XX веке, что говорит о её поздней фиксации в документах: многие однофамильцы могли получить фамилию при паспортизации 1930-х годов, когда крестьянские прозвища официально закреплялись.

Таким образом, Котяткина — типичная «детская» фамилия, образованная от уменьшительного прозвища Котятка, которое дали либо ребёнку, либо взрослому с мягким, «кошачьим» нравом. В ней нет сложной тайны, но есть живая связь с народной традицией называть людей по ласковым домашним прозвищам.