Фамилия Коюпченко — редкий случай, когда основа настолько тёмная, что даже этимологи расходятся в догадках, а версий больше, чем твёрдых фактов. Зато суффикс -енко выдаёт носителя с головой: это типичная фамилия украинского происхождения, образованная по модели, которая в XVII–XVIII веках закрепилась в среде казаков и крестьян Левобережной Украины. Окончание -енко означает «маленький» или «сын», то есть Коюпченко — буквально «сын (или потомок) Коюпка».

Главная загадка — корень «коюп-». В украинских говорах и в русских диалектах такого слова нет. Самая правдоподобная версия отталкивается от тюркского влияния: южные регионы Украины долго соседствовали с крымскотатарским и турецким населением. В турецком есть слово koyup — форма глагола «класть, ставить» (koymak). Прозвище Коюп мог получить человек, который что-то постоянно «клал» не туда, либо это была ироничная кличка для медлительного или рассеянного. Менее вероятно, но допустимо, что основа восходит к диалектному «коюпать» — в некоторых говорах так называли неуклюжую походку или шарканье ногами.

Третья версия — антропонимическая. Фамилия могла образоваться от личного имени или прозвища Коюп, которое, в свою очередь, является сокращением от более длинного канонического имени, например, от Кондрат или Коприй. Но это уже откровенное гадание: ни в одном из доступных источников по ономастике — ни у Унбегауна, ни у Никонова — фамилия Коюпченко не фигурирует, что подтверждает её редкость.

Географически фамилия почти не встречается за пределами бывшей Гетманщины. В современных базах данных носители Коюпченко единичны и сосредоточены в основном в Черкасской и Полтавской областях. Сословно предки, скорее всего, были казаками или крестьянами: украинские фамилии на -енко редко встречались у шляхты и почти никогда — у духовенства.

Так что если вы носите фамилию Коюпченко, то с большой вероятностью ваш предок получил прозвище от соседей за какую-то бытовую особенность или манеру поведения, а затем это прозвище закрепилось как родовое имя. Точнее сказать, увы, не получится — слишком мало следов оставила эта фамилия в письменных источниках.