Фамилия Кожущенко — редкий случай, когда основа, казалось бы, прозрачна, а вот механизм её образования сразу настораживает. Любой, кто хоть немного знаком с русскими фамилиями, заметит нестандартный суффикс. Если бы мы имели дело с типичной украинской или белорусской фамилией, она звучала бы как Кожух или Кожухов, Кожухович, Кожуховский. Суффикс -енко, указывающий на потомка («чей сын»), обычно крепится напрямую к основе: Кожух + енко = Кожушенко? Нет, в нашем случае появляется лишнее -щ-, что требует разбора.

Вероятнее всего, в основе лежит не слово «кожух» (тулуп, кожух для печи), а прозвище Кожуща. Это мог быть человек, связанный с выделкой кож или изготовлением кожухов, но с экспрессивным, уменьшительным или уничижительным оттенком. Суффикс -щ- в восточнославянских прозвищах иногда придавал значение «тот, кто имеет отношение к предмету, но в меньшей степени» или просто образовывал новое прозвище по действию. Кожуща — либо «маленький кожух» (нелестное прозвище для щуплого человека, который как будто в кожухе), либо «тот, кто возится с кожухами». От этого прозвища и пошёл патроним: Кожущин сын — Кожущенко.

Есть и вторая, более прозаическая версия: фамилия могла возникнуть из-за ошибки писаря или диалектного произношения. В говорах, где «ш» и «щ» смешивались (так называемое «щоканье»), фамилию Кожушенко (от Кожух + енко) могли записать на слух как Кожущенко. Со временем этот вариант закрепился. Если смотреть географию, фамилия встречается спорадически на территории современной Украины и в прилегающих областях России, но массового распространения не имеет, что скорее говорит в пользу первой версии: перед нами не описка, а локальное прозвище, которое дали одному конкретному роду.

Сословная принадлежность Кожущенко, скорее всего, крестьянская или казацкая. В реестрах Войска Запорожского встречаются фамилии на -енко, образованные от ремёсел (Швец, Коваль), и наш случай вписывается в этот ряд. Предок мог быть скорняком, кожевником или просто носил прозвище по характерной одежде — кожуху, который не снимал. Слово «кожух» в древнерусском языке означало не только шубу, но и броню, панцирь, так что теоретически прозвище мог получить и воин, но для фамилии Кожущенко эта версия слишком натянута: суффикс -енко указывает на бытовую, а не дружинную среду.