Фамилия Крашникова — женская форма, а её основа, мужская фамилия Крашников, образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: от прозвища или названия профессии с помощью суффикса -ник и фамильного суффикса -ов. Суффикс -ник в русских фамилиях почти всегда указывает на род занятий, характерный признак или склонность человека.

Корень здесь — «краш-», от глагола «красить». Но не спешите записывать предка в маляры или иконописцы. В старину «крашенина» — это крашеная, домотканая холстина, а «крашеничник» — мастер, который её красил, или торговец такой тканью. Прозвище Крашеник (или Крашник, как вариант) мог получить человек, занимавшийся окрашиванием тканей, либо тот, кто постоянно ходил в одежде из крашенины — то есть крестьянин средней руки, не в сермяге, а в крашеном. В говорах слово «крашеник» иногда означало и самого красильщика.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В псковских и тверских говорах «крашник» — это не только красильщик, но и «краюшка», горбушка хлеба. Вряд ли прозвище давали по любви к хлебу, скорее это могло быть ироничное именование худого или, наоборот, плотного человека — по ассоциации с формой. Однако профессиональная версия выглядит убедительнее: ремесленные прозвища часто становились фамилиями, а суффикс -ник в этом случае типичен.

Географически фамилия Крашниковых (и Крашниковых) рассеяна по всей центральной России, но заметный след оставила в Вятской губернии и на Урале. Там, где в XVIII–XIX веках активно работали кустарные красильни, прозвище красильщика могло закрепиться за целой династией. В отличие от фамилий на -ский, которые часто указывали на дворянское происхождение или владение землёй, Крашниковы — почти наверняка крестьянский или мещанский род, вышедший из ремесленной среды.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Красильников, Крашенинин, Крашенинников, — то Крашников стоит ближе к краткой, разговорной форме прозвища. Красильников — от «красильщик» (более официальное), Крашенинников — от «крашенинник» (торговец крашениной), а Крашников — от более простого, бытового «крашник». Это говорит о том, что предок, скорее всего, был не столько купцом, сколько рядовым мастеровым.