Фамилия Красцына — редкий случай, когда очевидная на первый взгляд основа обманчива. На слух она кажется производной от «красный», но морфология подсказывает иное. Суффикс -ин указывает на происхождение от личного имени или прозвища, оканчивающегося на -а/-я. Если бы основа была «красн-», фамилия звучала бы как Красина или Краснина. Здесь же корень — «красц-», и это меняет всё.

Вероятнее всего, в основе лежит слово «красец» или «красцы» — так в старых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, называли красное корневище марены красильной. Марену использовали для получения стойкого красного красителя для тканей. Человек, занимавшийся сбором, заготовкой или продажей этого растения, мог получить прозвище Красец, а его потомки — фамилию Красцыны. В этом случае предок носителя фамилии был либо крестьянином, промышлявшим побочным ремеслом, либо мелким торговцем красителями.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — связь с диалектным «красцы» (уменьшительное от «краски»). Так могли прозвать маляра, иконописца или красильщика тканей — мастера по краскам. Модель образования та же: прозвище Красец (или Краска) дало форму Красцын через промежуточный вариант на -ец.

По географии фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Архангельской, Вологодской, Костромской, где был развит кустарный промысел крашения холстов. Встречается она нечасто: по данным открытых источников, носителей Красцыных в России несколько сотен, и большинство живёт именно в этих регионах, что косвенно подтверждает ремесленную гипотезу.

Ударение в фамилии, судя по произносительной норме, падает на первый слог: Крáсцына. Вариант с ударением на ы (КрасцЫна) встречается реже и может быть следствием акающего говора или поздней миграции.