Фамилия Крисюченко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, самой распространённой в этой ономастике. Суффикс -енко исторически означал «маленький» или «сын» (сравните с русским -евич или польским -ич). В случае с Крисюченко основа указывает на личное имя или прозвище Крисюк. А оно, в свою очередь, восходит к христианскому имени Кирсан или, что вероятнее, к уменьшительной форме от Кирилл — Кирюша, Кирюха, Крисюк. На украинской почве звук [к] перед [и] мог смягчиться до [ц], отсюда и форма Крисюк. Таким образом, Крисюченко — это «сын Крисюка», то есть потомок человека, которого в быту звали Крисюком.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине. Там суффикс -енко в XVII–XVIII веках стал маркером казацкого и крестьянского происхождения, постепенно вытесняя старые патронимы на -ович. В метрических книгах XIX века Крисюченко встречается в основном в сёлах, где запись фамилии нередко зависела от грамотности писаря: варианты Крисюченко, Крисюк, Крисюченков могли чередоваться в одной семье.

С точки зрения словообразовательной модели фамилия стоит в одном ряду с десятками тысяч подобных: Коваленко, Шевченко, Ткаченко. Но её основа — Крисюк — не столь прозрачна, как, скажем, Коваль (кузнец). Здесь мы имеем дело не с ремеслом, а с личным именем, что делает фамилию менее «профессиональной» и более семейной. Есть и редкая версия, что Крисюк мог быть прозвищем от диалектного «крис» (крик, шум), но она не подкреплена серьёзными источниками и уступает основной — от имени Кирилл.

В современной России фамилия Крисюченко встречается рассеянно, но чаще всего на юге, в Краснодарском крае и Ростовской области, куда украинские переселенцы принесли её в XIX–XX веках. В украинском же ономастиконе она остаётся одной из многих, не претендуя на известность, но чётко указывая на своё происхождение: крестьянский род из центральной Украины, где имя Кирилл в бытовой форме Крисюк дало начало целому гнезду фамилий.