Фамилия Ктакян — одна из тех, что с первого взгляда кажутся «неудобными» для русского уха, но именно её звуковой облик выдаёт происхождение почти безошибочно. Это армянская фамилия, образованная по классической модели с суффиксом -ян, который в восточноармянском языке заменял более древний -янц и означает принадлежность к роду или происхождение от предка. Иными словами, Ктакян — это «из рода Ктака» или «потомок Ктака».

Основа фамилии — личное имя или прозвище Ктак. В армянском языке слово «кта́к» (գդակ) означает «шапка», «головной убор». Скорее всего, прозвище Ктак получил человек, который либо носил характерную, заметную шапку, либо занимался изготовлением или продажей головных уборов — то есть был шапочником. Такие прозвища по предметам одежды — распространённое явление в армянской ономастике: достаточно вспомнить фамилии Папаян (от «папак» — шапка) или Гуланян (от «гул» — шапка-ушанка).

Версия о происхождении от названия профессии выглядит более правдоподобной, чем гипотеза о тюркском корне. В турецком или азербайджанском языке слово kütak или kotek имеет значение «палка», «дубина», но для армянских фамилий такие заимствования в качестве личных имён нехарактерны. Кроме того, фамилия Ктакян практически не встречается в тюркоязычной среде, а сосредоточена именно в армянских диаспорах.

С точки зрения словообразования, фамилия Ктакян стоит в ряду таких же «прозвищных» армянских фамилий, как Дарбинян (от «дарбин» — кузнец), Восканян (от «воски» — золото, то есть ювелир) или Чухаджян (от «чуха» — суконная одежда). Все они указывают на ремесло или бытовую деталь, по которой предка прозвали в общине.

Географически фамилия Ктакян не привязана к какому-то одному региону исторической Армении. Она встречается среди потомков выходцев из Западной Армении (территория современной Турции) и Восточной Армении. Это говорит о том, что прозвище было достаточно распространённым и не являлось узколокальным.

В русском языке фамилия склоняется по правилам для армянских фамилий на -ян: Ктакян, Ктакяна, Ктакяну и так далее. Ударение, как правило, падает на последний слог — Ктакя́н, хотя в устной речи можно услышать и вариант с ударением на первый слог, что является калькой с армянского произношения.