Фамилия Ктоухова — редкий случай, когда основа читается почти как вопрос, но на самом деле это вариант старинного прозвища. Разберём её по косточкам.

Корень здесь — «ктоух» или «ктоухо». Самое правдоподобное объяснение: фамилия образована от прозвища, которое дали человеку с необычным ухом. В русских говорах слово «ухо» в сочетании с вопросительным местоимением могло превратиться в ироничное прозвище для того, у кого ухо торчало, было повреждено или просто обращало на себя внимание. Форма «ктоух» — это народная переделка, где «кто» усиливает вопрос: «кто это с таким ухом?». Прозвище могли закрепить за человеком, который постоянно переспрашивал или прислушивался, но связь с внешностью надёжнее.

Суффикс «-ов» указывает, что фамилия образована по патронимической модели: Ктоухов — сын Ктоуха. Женская форма Ктоухова — это соответственно дочь или жена Ктоухова. Мужской вариант фамилии — Ктоухов.

Вторая версия, хотя и менее вероятная, связывает основу с диалектным глаголом «ктоухать» — стучать, колотить. В этом случае прозвище могло относиться к мастеру, работающему с деревом или металлом, например, к бондарю или кузнецу. Но в говорах этот глагол редок, а внешняя характеристика по уху встречается в русской ономастике гораздо чаще.

Географически фамилия Ктоухова встречается в единичных записях, в основном на территории бывшей Вятской губернии и в Зауралье. Это зона, где любили прозвища с яркой образностью и необычной фонетикой. В метрических книгах XIX века попадаются фамилии того же корня — Ктоуховы, Ктоуховские, что подтверждает локальный характер прозвища.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает прояснить картину. Есть фамилия Ухов — от прозвища «Ухо», и Ктоухов — её усложнённая форма с вопросительным элементом, который, скорее всего, добавился для усиления выразительности. Похожий приём видим в фамилиях типа Неуймин (от «не уймёшь») или Неупокоев (от «не покой»), где прозвище строится на отрицании или вопросе. Ктоухов — из того же ряда словесных портретов.

Таким образом, предок современных носителей фамилии Ктоухова, вероятнее всего, получил прозвище за приметную особенность уха — и это прозвище, пройдя через века, закрепилось в официальной фамилии.