Фамилия Кудкудак — редкий случай в русской ономастике, когда прозвище образовано напрямую от звукоподражания. В основе лежит глагольное междометие «куд-куда», которым в народе передавали куриное кудахтанье. Носитель такой фамилии вряд ли был птицей — скорее, это прозвище человека с характерной манерой речи, торопливой или сбивчивой, напоминающей куриный переполох. В говорах «кудкудакать» означало «говорить без умолку, тараторить», иногда — «суетиться без толку». Так могли прозвать болтливого соседа, суетливого работника или, наоборот, человека, который постоянно покрикивал на домашних, как наседка на цыплят.

Обращает на себя внимание суффикс -ак. В русских фамилиях он типичен для прозвищ, образованных от глаголов: Кричак (от «кричать»), Стукак (от «стучать»). Ударение в фамилии падает на последний слог — Кудкуда́к, что тоже характерно для подобных образований. Форма без патронимического суффикса (-ов, -ин) говорит о том, что фамилия закрепилась в том виде, в каком её дали, возможно, в среде однодворцев или казачества, где прозвища нередко переходили в фамилии напрямую.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям — Курской, Воронежской, Ростовской. Встречается и у украинцев, где аналогичное прозвище Кудкудак имеет те же корни. В документах XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировались редко, но в переписных книгах южных уездов можно найти «Кудкудака» как личное именование. Со временем прозвище стало фамилией, и сейчас её носители живут в основном в центральной России и на Украине.

Других версий происхождения, кроме звукоподражательной, у фамилии нет. Попытки связать её с тюркскими корнями или географическими названиями несостоятельны — ни в одном из известных языков нет близкого по звучанию слова со значением, которое могло бы дать прозвище. Так что Кудкудак — чисто русская (и украинская) фамилия, родившаяся из живого народного наблюдения за речью и поведением человека.