Фамилия Кугитко — редкий пример, где основа, суффикс и география бытования складываются в одну непротиворечивую картину. В её основе лежит прозвище Кугит, которое образовано от украинского слова «куга» — болотного безлистного растения с круглым стеблем. Из куги издавна плели хозяйственную утварь, циновки, оплетали стулья, то есть она была привычным поделочным материалом в украинских сёлах. Скорее всего, первый носитель прозвища Кугит либо сам занимался таким ремеслом, либо получил именование по характерному признаку: например, по месту жительства у зарослей куги или по внешней схожести с этим тонким, прямым стеблем.

Суффикс -ко указывает на украинское происхождение фамилии. В украинской ономастике этот формант типичен для фамилий, образованных от прозвищ и имён: он выполнял роль уменьшительности или просто оформлял фамилию по модели, принятой в определённой местности. Кугитко буквально означает «потомок или сын Кугита». Похожая модель встречается у фамилий Кулитко, Кудирко, Куценко, хотя Кугитко стоит несколько особняком из-за редкости исходного прозвища.

Само прозвище Кугит — нечастое. В отличие от более распространённых Кулиш, Кулик или Кугут, оно не фиксируется в крупных исторических словарях прозвищ, что говорит о его локальном, возможно, даже односельском бытовании. Фамилия Кугитко встречается прежде всего в западных и центральных областях Украины, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Ставрополье — там, где украинская диалектная лексика сохранялась дольше всего. В России фамилия редкая, и её носители, скорее всего, происходят из семей, выехавших с Украины в ходе столыпинской аграрной реформы или более поздних миграций.

Слово «куга» родственно русскому «осока» и другим славянским названиям болотных растений. Если бы прозвище закрепилось в русской среде, оно, вероятно, получило бы суффикс -ов (Кугитов) или -ин (Кугитин). Но форма Кугитко сохранила именно украинскую словообразовательную модель, и это главная улика: фамилия не «переводилась» на русский лад, а осталась в исходном виде, что для прозвищных фамилий ремесленников — скорее исключение, чем правило.