Фамилия Кугурлуяну — редкий случай для русского уха, и её происхождение сразу выводит за пределы славянского мира. Это яркий представитель молдавских и румынских фамилий, образованных при помощи суффикса -яну. В ономастике этот суффикс — аналог русского -ов/-ев: он указывает на принадлежность к роду, месту или лицу. В румынском языке суффикс -eanu (в русской передаче часто -яну) означает «выходец из» или «потомок». Так, фамилии вроде Кишинёвяну (из Кишинёва) или Брэиляну (из Брэилы) прямо говорят о географическом корне.

Основа фамилии — Кугурлуй или Кугурулуй. Здесь возможны два объяснения, и оба связаны с тюркским наследием южных степей. Первое: слово может восходить к тюркскому kügür — «глухой» или «глухой звук», что могло стать прозвищем для человека с глуховатым голосом или, метафорически, для замкнутого, необщительного человека. Второе, более вероятное: Кугурлуй — это топоним. В Буджаке (историческая область на юге современной Одесщины и Молдовы) есть озеро Кугурлуй, а также село Кугурлуй в Одесской области Украины. Название озера, скорее всего, имеет ногайские корни: в ногайском языке kügir означает «синий» или «серый», а -luy — аффикс обладания. То есть Кугурлуй — «синеватое» или «серое» озеро.

Таким образом, фамилия Кугурлуяну буквально означает «потомок того, кто из Кугурлуя» или «выходец из местности Кугурлуй». Предки носителя этой фамилии, скорее всего, жили в селе Кугурлуй или на берегу одноимённого озера, а затем, при получении фамилии в XIX веке (в Бессарабии фамилии массово закреплялись после вхождения в состав Российской империи), получили прозвание по месту выхода. Суффикс -яну типичен для северо-восточной Румынии и Молдовы, что дополнительно подтверждает бессарабские корни рода.

В русском языке фамилия сохраняет ударение, характерное для румынского: на предпоследний слог — Кугурлу́яну. Варианты написания в документах могут встречаться с одной «у» (Кугурляну) или с заменой «у» на «о» под влиянием устной речи, но исходная форма — через «у» в корне. Фамилия очень редкая: за пределами Молдовы и прилегающих областей Украины её носители встречаются единично, что делает её своеобразным маркером конкретной географической точки на карте Буджака.