Фамилия Кунпейсова — редкий случай, когда женская форма фамилии встречается в источниках чаще мужской, что связано с известной казахской поэтессой Мариейм Кунпейсовой. Однако разбирать её нужно через мужскую основу — Кунпейсов, которая образована от личного имени Кунпейс.

Имя Кунпейс — составное, тюркского происхождения. Первая часть «кун» (күн) в казахском и других тюркских языках означает «солнце». Вторая часть «пейс» (бейіс) — арабское заимствование, означающее «рай», «сад». Таким образом, Кунпейс дословно переводится как «солнечный рай» или «солнечный сад». Это имя давали с пожеланием ребёнку светлой, благодатной жизни, как в раю, освещённом солнцем.

Модель образования фамилии типична для казахских фамилий, русифицированных в советский период. К основе Кунпейс добавили русский патронимический суффикс -ов (в женской форме -ова). Такое оформление массово закрепилось в 1930–1940-е годы, когда казахам предписали иметь фамилии по русскому образцу. До этого носители имени Кунпейс обходились отчеством (Кунпейсулы) или родовым именем.

Географически фамилия Кунпейсова привязана к западному Казахстану, особенно к Атырауской и Мангистауской областям. Там имя Кунпейс встречается в исторических записях XIX века. Сословно предки Кунпейсовых, скорее всего, были скотоводами-кочевниками, жившими родами, так как имя не несёт аристократической окраски и не связано с духовным званием (ходжа, ишан).

Интересная деталь: в отличие от многих казахских фамилий, оканчивающихся на -ов/-ева, Кунпейсова сохранила исходное имя почти без фонетических изменений. Это говорит о том, что имя Кунпейс было устойчивым и узнаваемым в своей среде, его не переделывали в более привычное русское ухо «Кунпесов» или «Кунпеисов». Встречаются единичные варианты написания через «е» — Кунпейсова, но это скорее ошибки паспортистов.