Фамилия Кусемисов образована от мужского личного имени Кусемис. Скорее всего, это диалектный вариант тюркского имени Кусямеш, которое означает «долгожданный». Таким именем родители могли наречь первенца, которого ждали особенно долго.

Разберём словообразовательную модель. К основе Кусемис прибавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кусемисов, то есть сын Кусемиса. Такая модель типична для фамилий, возникших в среде, где тюркские имена адаптировались к русской грамматике. Суффикс -ов, а не -ин, подсказывает, что основа имени оканчивалась на согласную.

Фамилия редкая и географически привязана к регионам, где веками соседствовали русские и тюркские народы: Поволжье, Приуралье, южные степи. В переписях XVIII–XIX веков фамилию Кусемисов могли записать как Кусемисов, Кусямисов или даже Кусямешев — вариации зависели от грамотности писаря и местного произношения.

В ономастических справочниках эта фамилия не упоминается широко, что объяснимо: она восходит к личному имени, которое почти не встречается в современных тюркских антропонимиконах. Кусямеш — архаичная форма, вытесненная более употребительными именами. Поэтому фамилия Кусемисов — живое свидетельство давних контактов двух языковых традиций, сохранившееся в единичных родах.