Фамилия Кусубалиев — редкий случай, когда географический и языковой анализ почти сразу даёт ответ без долгих споров. Её основа тюркская, и в первую очередь она указывает на казахские или башкирские корни. Встречается фамилия преимущественно в Казахстане и среди башкирского населения России, что сразу сужает круг поиска.

Разбираем словообразовательную модель. Суффикс -ев (а не -ов) указывает на то, что основа оканчивается на мягкий согласный или на гласный, в данном случае — на -и. Сама же основа Кусубали распадается на две части: «Кусу» и «бали». «Кусу» — это тюркское личное имя или его компонент, восходящий к слову «кус» (птица) или к глаголу со значением «спасать, уберегать». Второй компонент — «бали» — это вариант имени Бали (от арабского «бали» — «старый, древний» или как форма имени Вали, означающего «святой, покровитель»). Таким образом, Кусубали — это составное имя (Кусу + Бали), что типично для тюркской антропонимии, где два имени или прозвища сливались в одно.

Есть и другая, менее вероятная версия. В казахском языке «кусу» означает «рвать, тошнить». Но связывать фамилию с таким значением напрямую было бы натяжкой: вряд ли такое прозвище стало бы основой для родового имени. Скорее всего, «Кусу» здесь — это именно имя, а не бытовое слово.

Фамилия Кусубалиев образована по русской модели патронимических фамилий: к основе Кусубали добавили суффикс -ев, означающий «сын Кусубали». Это типичный пример взаимодействия тюркских имён с русской фамильной системой, которая распространилась среди народов Российской империи в XIX — начале XX века. Носители фамилии — потомки человека по имени Кусубали, который, судя по составу имени, мог быть уважаемым старейшиной или человеком, связанным с птицами (например, сокольничим или охотником).

Сравните с однокоренными фамилиями: Кусубаев (где «бай» — богатый), Кусумбаев (с вариантом «сумбай»). Кусубалиев стоит особняком из-за второго компонента «бали», что делает её более редкой и узколокальной. Если ваши предки носили эту фамилию, их корни — скорее всего, в северном или центральном Казахстане, либо в Башкортостане, где составные имена с «бал» (от «бал» — мёд, сладость) тоже встречаются, но здесь именно «бали» — арабское заимствование.