Фамилия Кужом — редкая и структурно необычная для русского языка. В ней нет привычного фамильного суффикса (-ов, -ин, -ский), а окончание -ом указывает на то, что перед нами, скорее всего, застывшая форма творительного падежа. Такие фамилии в русской среде встречаются крайне редко и обычно имеют иноязычное происхождение.

Скорее всего, Кужом — это русифицированная форма тюркской или финно-угорской фамилии. Основа «куж» встречается в нескольких языках Поволжья и Урала. В коми-пермяцком и удмуртском языках «куж» означает «сила», «мощь», а «кужис» — «силач», «умелец». В тюркских языках (татарском, башкирском) близкое слово «куш» значит «птица», но переход «ш» в «ж» нехарактерен. Поэтому версия с финно-угорским корнем выглядит убедительнее: фамилия могла возникнуть из прозвища Куж («сильный») с последующим наращением русского падежного окончания -ом, которое закрепилось при записи в документах.

По модели образования фамилия Кужом похожа на украинские или польские фамилии в творительном падеже (типа Гаврилюком, Ковалём), но в русской среде она могла возникнуть иначе. Возможно, предок носителя фамилии был выходцем из коми-пермяков или удмуртов, а при переписи населения русский писарь записал его прозвище в том виде, в каком услышал в речи: «Кужом» — то есть «(прозванный) Кужом». Окончание -ом здесь играет роль не фамильного суффикса, а грамматического показателя, который «застыл» и стал частью фамилии.

Географически фамилия тяготеет к регионам расселения финно-угорских народов: Пермский край, Удмуртия, Кировская область. Встречаемость её крайне низкая, что подтверждает версию о локальном происхождении от конкретного прозвища или имени. В дореволюционных метриках фамилия могла записываться по-разному: Кужомов, Кужумов, но форма без суффикса — самая архаичная.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Кужев, Кужов, Куженков) показывает, что основа «куж» в русском ономастиконе не была распространена. Это дополнительный аргумент в пользу того, что Кужом — не случайное искажение, а сохранившаяся в первозданном виде фамилия, возникшая на стыке языковых традиций.