Фамилия Квахненко звучит на слух необычно, но её происхождение укладывается в простую и распространённую модель. Перед нами типичная украинская фамилия, образованная с помощью патронимического суффикса -енко. Этот суффикс в украинской ономастике означает «сын» или «потомок», то есть Квахненко — буквально «сын Квахны» или «потомок Квахны».

Основа фамилии — прозвище Квахна. В украинском языке слово «квахтати» (или «квоктати») означает звуки, которые издаёт наседка, созывая цыплят. Соответственно, «квахна» — это курица-наседка. Прозвище Квахна могли дать человеку по нескольким причинам. Самая вероятная — за манеру говорить: квохчущий, немного гнусавый голос. Реже — за внешность или за характер: полный, домовитый человек, который постоянно «хлопочет» над домашним хозяйством, как наседка над цыплятами.

В русском языке есть похожий глагол «квохтать», поэтому фамилия могла возникнуть и в южнорусских говорах, но суффикс -енко указывает на украинскую среду. Фамилия Квахненко встречается преимущественно на востоке Украины и в прилегающих областях России, особенно на Кубани, куда в XIX–XX веках активно переселялись украинцы. Встречаются и варианты написания: Квохненко, Квахна, но Квахненко — самый частый.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Квахненко стоит в одном ряду с Квашой, Квашниным, Квасницей, но с другой семантикой: там основа — «квас» или «квашение», а здесь — звукоподражание. Интересно, что прозвище Квахна могло быть ироничным: так могли назвать не только заботливого отца семейства, но и, наоборот, суетливого и беспокойного человека.

Таким образом, предок носителя фамилии Квахненко — человек с прозвищем Квахна, скорее всего, обладавший характерным голосом или поведением, напоминающим квохчущую наседку. Фамилия не дворянская, не крестьянская в сословном смысле — она из народной среды, где прозвища давали метко и без чинов.