Фамилия Кюфалян — одна из тех, что сразу выдают армянское происхождение носителя. Её выдают суффикс -ян и корень, который не встречается в славянских языках. В армянской ономастике формант -ян (а в старой орфографии — -янц) означает принадлежность к роду, то есть буквально «из дома такого-то». Поэтому Кюфалян — это «из рода Кюфалов».

Корень «Кюфал» — самое интересное. В армянском языке нет прямого слова «кюфал» со значением профессии или предмета. Скорее всего, это фамилия, образованная от прозвища. Самая вероятная версия: в основе лежит диалектное или искажённое «куфал» (գուֆալ) — в некоторых говорах так называли горбатого или сутулого человека. Слово восходит к армянскому «куз» (горб) с характерным для ряда диалектов переходом «з» в «ф». Таким образом, родоначальник Кюфалян мог получить прозвище за характерную осанку.

Менее убедительная, но тоже возможная гипотеза связывает фамилию с тюркским «кюф» (пена, накипь) или с греческим «кефали» (голова). Однако для армянской фамилии тюркская основа с таким суффиксом маловероятна, а греческая версия не объясняет появления звука «ф» в середине слова — в греческом «кефали» дало бы вариант вроде «Кефалян». Поэтому версия с «горбуном» остаётся основной.

Географически фамилия Кюфалян тяготеет к западным областям исторической Армении и к среде армянских переселенцев. В России и странах Закавказья она встречается редко, что говорит о её локальном происхождении — вероятно, из района Вана или Малой Азии, где в армянских говорах слово «куфал» было в ходу. Социальный состав носителей типичен для армянских фамилий на -ян: это могли быть и ремесленники, и крестьяне, и духовенство — суффикс не указывает на сословие, только на родство.

По написанию фамилия устойчива: варианты «Кюфалянц» (с конечным -ц) встречаются в дореволюционных записях и у диаспоры, но в современном русском языке закрепилась форма Кюфалян. Ударение, судя по армянской фонетике, падает на последний слог — Кюфаля́н.