Фамилия Кюков — редкая и неочевидная. На первый взгляд в ней угадывается иноязычная основа: сочетание «Кю» нехарактерно для исконно русских корней. Действительно, перед нами один из примеров адаптации нерусского прозвища в русской фамильной модели.

Словообразовательный разбор прост: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а основа — Кюк. Именно в происхождении этой основы и кроется главная загадка. Самая правдоподобная версия связывает фамилию с тюркскими языками. В них слово «кюк» или «кёк» (в разных диалектах) означает «синий», «голубой», а также «небо» или «корень». У многих тюркских народов (татар, башкир, чувашей) прозвище Кюк (Кёк, Кук) могло даваться человеку с голубыми глазами или светлыми волосами — признак, выделявшийся в среде с преобладанием темных глаз и волос. Менее вероятна, но возможна связь с древнетюркским «кюк» — «сила, мощь».

Есть и другая гипотеза, хотя и более спорная. В некоторых русских говорах, особенно на северо-западе, фиксировалось слово «кюка» — так называли скучного, плаксивого человека или, наоборот, того, кто «кюкает» (тихо плачет, ноет). Однако эта версия слабее: во-первых, фамилия Кюков почти не встречается в регионах бытования этого диалектизма, во-вторых, тюркский след для такой необычной основы выглядит убедительнее.

Географически фамилия Кюков крайне редка. Основные очаги её встречаемости — Поволжье и Урал, то есть регионы многовекового контакта русского и тюркского населения. Это косвенно подтверждает версию о тюркском прозвище. Предок современных Кюковых, скорее всего, был крещеным татарином, башкиром или чувашом, носившим в миру прозвище Кюк. При переходе в православие или при переписи это прозвище оформили в стандартную русскую фамилию с суффиксом -ов.

В отличие от фамилий на -ин или -ский, модель Кюковых — типично «прозвищная», образованная напрямую от личного имени-характеристики. Сословная принадлежность могла быть любой: от крестьян до служилых людей «по прибору», но из-за редкости фамилии проследить её историю по архивам непросто.