Фамилия Кюсашки — настолько редкая, что при первом взгляде кажется иноязычной. Однако, если присмотреться, в ней просматривается типично русская модель образования с суффиксом -к-, который в фамилиях часто указывает на принадлежность по месту или прозвищу. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая в среде, где говорили на смеси русского и тюркских языков, или же сильно искажённая при записи.

Наиболее вероятная версия связывает Кюсашки с тюркским словом «кюсак» или «кюса», которое в разных диалектах означает «мешок», «сума» или «утроба». В таком случае прозвище Кюсак могли дать либо человеку, который шил мешки или торговал ими, либо, что встречается чаще, полному, «пузатому» мужчине. Суффикс -к- (в форме Кюсак-а) превратил прозвище в фамилию, а окончание -и указывает на множественное число — то есть на «род Кюсаков» или «семья Кюсака». В русской традиции фамилии на -ки, -их, -ых (как Кюсашки) закрепились в северных и центральных губерниях, особенно в Вологодской, Архангельской и Ярославской областях.

Менее правдоподобна, но возможна версия от калмыцкого или монгольского слова «кюс» — «сила», «мощь». Тогда Кюсашки — ослабленная форма от «Кюсовы» или «Кюсановы», где суффикс -шки возник из-за диалектного произношения. Однако эта гипотеза слабая, так как не объясняет конечное -и.

Примечательно, что фамилия Кюсашки не встречается в классических справочниках русских фамилий (Б. Унбегаун, В. Никонов). Это говорит о том, что она либо локальная — бытовала в одном-двух сёлах, либо возникла поздно, в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам. Носители такой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, а их предок носил яркое прозвище Кюсак — мешковатый, полный или занимавшийся выделкой мешков.