Фамилия Кызыргали — один из тех случаев, когда фамилия почти без изменений перешла из личного имени в наследственное прозвище. В её основе лежит тюркское (скорее всего, казахское) составное имя Кызыргали, которое, в свою очередь, восходит к арабским корням. Первая часть, «Кызыр» (или «Хызыр»), — это имя пророка Хызра (аль-Хадира), почитаемого в исламе как хранитель воды, вечный странник и помощник в беде. Вторая часть, «Гали» (от арабского «Али» — «высокий», «великий»), — одно из имён Аллаха и имя четвёртого праведного халифа.

Таким образом, Кызыргали можно перевести как «Хызр и Али» или «принадлежащий (под покровительством) Хызра и Али». В тюркской ономастике такие двусоставные имена-обереги были распространены: родители надеялись, что ребёнок будет защищён сразу двумя святыми. Фамилия закрепилась в форме, максимально близкой к исходному имени, без типичных русских суффиксов (-ов, -ев, -ин). Это характерно для фамилий, которые оформились в среде казахов, татар или башкир, где русская административная машина часто фиксировала имя как есть, особенно в XIX — начале XX века.

Географически фамилия тяготеет к регионам Казахстана, Оренбургской, Астраханской областям России, а также к Башкортостану. Встречаются варианты написания: Хызыргали, Хазрагали, Кызрали, но «Кызыргали» — самый распространённый и фонетически точный. Социально предки носителя этой фамилии с высокой вероятностью были не из знати, а из среды простых скотоводов или крестьян, получивших имя по религиозной традиции. В отличие от фамилий, образованных от профессий или географических названий, Кызыргали — чисто антропонимическая, то есть произошедшая напрямую от личного имени.

Если искать однокоренные параллели, то в той же среде бытуют фамилии Кызыров, Галиев, Хызров. Но Кызыргали стоит отдельно — это не суффиксальное производное, а застывшая полная форма имени, которая не даёт сократить себя до «Кызыров» или «Галиев». Такая фамилия — редкий пример того, как исламская ономастика сохранилась в русском документообороте в первозданном виде, без переделки на славянский лад.