Фамилия Кжичковский — редкий случай, когда польское происхождение читается почти без искажений, даже в русской записи. Её основа — польское слово krzyk («крик»). В польском языке есть целое гнездо фамилий, образованных от этого корня: Кшик, Кшиковский, Кшижановский, и наша Кжичковский — одна из них.

Суффикс -овский (польск. -owski) — типичный для шляхетских фамилий, указывающий на владельческий или топонимический характер. Такую фамилию обычно получали по названию имения или местечка. В данном случае исходным пунктом могло быть село Кжички (Krzyczki) или Кжичково (Krzyczkowo). Такие названия нередки в Мазовии и на юго-востоке Польши, где топонимы от krzyk означали либо «крикливый, шумный» (возможно, из-за птиц или людской толпы), либо место, где что-то «кричало» — например, скрипучая мельница или ветряк.

Другая, менее вероятная версия — происхождение от личного прозвища Krzyk («Крикун»). Если предок был обладателем громкого голоса, его могли прозвать Кшик, а потомки, перейдя в шляхетское сословие, «удлинили» фамилию до Кжичковский, добавив дворянский суффикс. В польской ономастике этот процесс назывался «шляхетизацией» фамилии — добавление -owski к простому прозвищу, чтобы звучало солиднее.

В русской передаче фамилия сохранила польское сочетание «Кж» (к + ж), которое для восточнославянского уха звучит непривычно. В XIX веке, при переселении в Российскую империю, такие фамилии нередко русифицировали: Кжичковский мог превратиться в Кричковского или Крычковского, но исходный вариант устоялся, вероятно, потому что носители держались католической традиции и польского самоощущения.

Искать корни Кжичковских стоит в метрических книгах римско-католических приходов бывших Царства Польского и Западного края. Встречаемость фамилии сегодня крайне низкая, что подтверждает её локальный, возможно, даже однородовой характер: почти все носители, скорее всего, восходят к одному предку из конкретного села.