Фамилия Лайдёнова — женская форма фамилии Лайдёнов, и её разбор стоит начать с необычного суффикса. Подавляющее большинство русских фамилий образовано с помощью суффиксов -ов/-ев или -ин. Здесь же мы видим редкий суффикс -ёнов. Он указывает на происхождение от имени или прозвища, оканчивающегося на -ёня. Такая модель встречается в основном в северных и центральных губерниях России, где сохранялись архаичные формы словообразования. Основа фамилии — Лайдён, скорее всего, восходит к прозвищу Лайдя или Лайдёня.

Самая вероятная версия связывает основу с диалектным глаголом «лайдать» — то есть лаять, браниться, шуметь. В некоторых говорах «лайда» означала крикуна, сварливого человека или того, кто постоянно ворчит. Прозвище могли дать человеку с громким голосом или вспыльчивым характером. В ономастических справочниках (например, в работах В. А. Никонова) указывается, что фамилии на -ёнов нередко возникали в среде крестьян и посадских людей, где прозвища были прямыми и отражали поведение или внешность.

Менее правдоподобная, но возможная версия связывает фамилию с финно-угорскими корнями, поскольку в северных регионах (Архангельская, Вологодская области) встречаются топонимы и прозвища, заимствованные из карельского или вепсского языков. Однако убедительных параллелей для «лайда» в этих языках нет, поэтому версия с русским диалектным глаголом выглядит предпочтительнее.

Примечательно, что фамилия Лайдёнов (и её женская форма) крайне редка. Она не фиксируется в массовых списках дворянских или купеческих родов, что подтверждает её крестьянское происхождение. Носители фамилии, скорее всего, происходят из одной локальной группы — например, из бывших государственных крестьян северных уездов. В современной России фамилия встречается единично, что делает её особенно ценной для семейной истории: каждый носитель может проследить родство по узкой ветви без путаницы с однофамильцами.