Фамилия Линсенко звучит на украинский лад, но её основа неочевидна. Суффикс -енко — типичный для восточной Украины, он указывает на происхождение от отца или на принадлежность к его роду. Вопрос в том, что за имя или прозвище лежит в корне.

Самая прямая версия — отчество от имени Линс. Это могла быть сокращённая форма от канонического имени Лин (редкое, но встречавшееся в святцах) или от западноевропейского Линс, которое проникло в Россию и Малороссию через переселенцев или через немецкие колонии. В таком случае Линсенко — «сын Лина».

Другая, более прозаичная версия — прозвище от диалектного слова. В южнорусских и украинских говорах «лин» — это рыба линь. Прозвище Линь могли дать медлительному, вялому человеку или, наоборот, тому, кто ловил и торговал линями. Суффикс -енко приращивается к основе Линь, и в написании «ь» мог исчезнуть: Линь → Линенко. Со временем фамилия могла закрепиться в форме Линсенко под влиянием других моделей (например, как Гриценко от Грицько).

Есть и третья возможность, менее вероятная, но не исключённая: фамилия могла возникнуть от прозвища Линс — искажённого «линза» или «линц» (от диалектного «линцевать» — притворяться, хитрить). Однако это лишь догадка, не подкреплённая устойчивой традицией.

В любом случае, фамилия Линсенко — редкая. Её носители, скорее всего, происходят из восточных областей Украины или из смешанных русско-украинских регионов, где суффикс -енко был основным способом фамилеобразования. Точных данных о сословной принадлежности нет, но такие фамилии чаще всего возникали в крестьянской и казачьей среде.