Фамилия Лисинас — редкий для России случай, когда фамилия сохранила литовскую модель образования. Она происходит от литовского слова lapė (лиса) или lāpas (лист), но в форме, адаптированной через суффикс -и́нас (-inas). В литовской ономастике суффикс -inas — один из самых распространённых патронимических показателей, он указывает на принадлежность: «сын такого-то» или «происходящий от такого-то». Таким образом, Лисинас буквально означает «лисий» или «сын Лиса» (прозвище Лис).

Интересно, что в русском языке эта фамилия почти не встречается, зато обычна среди литовцев и поляков литовского происхождения. В Литве существует фамилия Lapinas (Лапинас) — с тем же корнем, но через другую огласовку. Лисинас — это, скорее всего, русифицированная запись литовской фамилии: звук «а» перешёл в «и» под влиянием русского произношения или письменной фиксации.

Предок носителя фамилии мог получить прозвище Лис за хитрость, рыжий цвет волос или даже за внешнее сходство с этим зверем. В литовской традиции прозвища, связанные с животными, давали не только по характеру, но и по роду занятий: например, охотнику на лис. Есть и менее вероятная версия — от слова līst (ползти, пробираться), но она противоречит фонетике: в таком случае фамилия звучала бы как Листинас.

Географически фамилия привязана к западным регионам бывшей Российской империи — Литве, Беларуси, польскому Подлясью. В России Лисинас — большая редкость, её можно встретить в основном у потомков литовских переселенцев или ссыльных. По сословию — скорее всего, крестьянская или мещанская, поскольку патронимы на -inas в Литве были массовыми у простого народа. В советское время фамилию могли «обрусить» до Лисина или Лисова, но оригинальная форма сохранилась у тех, кто держался за национальные корни.