Фамилия Лиубканен — явный случай, когда написание исказило первоначальную форму. Скорее всего, перед нами финская или карельская фамилия, которую при паспортизации или в бытовой записи переделали на русский лад. Исходный вариант — Любканен или Люпкянен. Основа «любк-» в прибалтийско-финских языках восходит к слову «люпкя» (lypkyä) — «слякоть», «жидкая грязь», «мокрый снег». В старой Карелии и Финляндии такое прозвище могли дать человеку, жившему на болотистой, сырой низине, либо тому, кто работал с глиной или торфом. Суффикс -нен в финской ономастике — типичный патронимический или топонимический показатель, означающий «из рода такого-то» или «житель такого места». То есть Лиубканен — это «человек из рода Любка» или «живущий у слякотного места».

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование: основа могла произойти от карельского диалектного слова «любка» — «любимый», «милый». Тогда фамилия означала бы «сын любимого» или «потомок того, кого любили». Однако для финно-угорской модели образования фамилий от качественных прилагательных это редкость: обычно такие прозвища давали не детям, а самому человеку — и суффикс -нен тут необязателен.

География фамилии сегодня — северо-запад России: Карелия, Ленинградская область, отдельные носители есть в Мурманской области и в Финляндии (там она пишется как Lyubkanen или Lyypykänen). В XIX веке носители фамилии были в основном крестьянами и мелкими ремесленниками — лесорубами, рыбаками, смолокурами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Орфография «Лиубканен» с буквосочетанием «иу» — скорее всего, ошибка писарей XIX века, которые по-русски передавали финское «jy» или «y» как «иу» (сравните: финское «jyvä» — зерно, в русских метриках иногда писали «иува»). Встречаются также варианты Любканен, Лубканен и Лыбканен.