Фамилия Лонюшкина — женская форма фамилии Лонюшкин, которая относится к распространённому в России типу фамилий на -ин. Эта модель указывает на принадлежность: Лонюшкин буквально значит «сын (или потомок) Лонюшки». А вот с самим именем или прозвищем Лонюшка всё сложнее.

Самая вероятная версия связывает основу с диалектным словом «лонь» или «лоня» — в северных и сибирских говорах так называли прошлогоднюю траву, а также нечто старое, залежалое. В переносном смысле «лоня» могло стать прозвищем медлительного, вялого человека или того, кто ходит в старой, поношенной одежде. Суффикс -юшк- в этом случае носит уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный оттенок, характерный для народных форм имён и прозвищ (сравните: Ванюшка, Матюшка). Таким образом, Лонюшка — это «маленький лоня» или «лоня» с ласковой окраской.

Менее убедительна, но возможна связь с каноническим именем Леонтий. В народной речи имя Леонтий могло сокращаться до Лоня, а затем с помощью того же суффикса -юшк- образоваться в Лонюшка. Однако для фамилии Лонюшкин эта версия слабее: имя Леонтий дало фамилии Леонтьев и Леонов, а форма Лонюшка слишком далека от исходного имени и редка в документах.

Географически фамилия Лонюшкин встречается нечасто, но прослеживается в центральных и северных областях России — в Вологодской, Костромской, Архангельской губерниях, где диалектное слово «лонь» было в ходу. Это косвенно подтверждает прозвищное происхождение. Встречается также вариант написания Ланюшкин — возможно, результат акающего произношения.

Итак, предок современных Лонюшкиных, скорее всего, получил прозвище Лонюшка за медлительность или небрежный вид, а его потомки стали носителями фамилии, закрепившей эту бытовую характеристику в родовом имени.