Фамилия Лопперунгаева — не просто редкая, а единичная в русском ономастиконе. Она практически не встречается ни в исторических документах, ни в современных телефонных справочниках, ни в базах данных переписей. Это сразу подсказывает главное: перед нами, скорее всего, искусственное, книжное или канцелярское образование, возникшее не в крестьянской среде, а в результате сознательного творчества — например, в духовном сословии или при переводе фамилии с другого языка.

Разбор основы даёт ключ к пониманию. В ней отчётливо слышится иноязычный корень «лоппер» или «лопер». В голландском и нижненемецком языках «looper» означает «бегун», «скороход», а также «петля» (от «lopen» — бежать, ходить). В русской семинарской традиции XVIII–XIX веков было принято переводить фамилии учеников на латынь или греческий, а также давать «говорящие» фамилии по характеру или внешности. Возможно, предок носителя получил прозвище «Бегун» или «Скороход», которое при поступлении в семинарию переделали в благозвучную латинизированную форму — Лоппер, а затем добавили русский суффикс -унгаев, характерный для фамилий тюркского или монгольского происхождения (сравните: Тунгаев, Кунгаев, Унгаев).

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: основа восходит к фамилии Лоппер (немецкая или еврейская), а суффикс -унгаев мог появиться при русификации в среде калмыков или бурят, где такие окончания типичны. Однако полное отсутствие фамилии в регионах традиционного проживания этих народов говорит против этого.

Третий вариант — чисто искусственное происхождение. В XIX веке в духовных училищах иногда давали фамилии от случайных слов или географических названий, переделанных на иностранный лад. «Лоппер» могло быть искажением названия города (например, Лопперсюм в Нидерландах) или фамилии преподавателя.

Таким образом, фамилия Лопперунгаева — почти наверняка «семинарская» или «училищная», созданная по модели «иноязычный корень + русский фамильный суффикс». Носитель её, скорее всего, происходит из семьи священнослужителей или, реже, из среды образованных горожан, получивших фамилию при поступлении в учебное заведение. Географически она может быть привязана к центральным губерниям России, где располагались семинарии.