Фамилия Лудзенек — редкий случай, когда географический корень почти полностью проясняет её происхождение. Основой, скорее всего, послужил топоним Лудза — название города и озера на востоке Латвии, в исторической области Латгалия. Модель образования здесь нехарактерна для русской ономастики: суффикс -ек в сочетании с основой на -ен — это типичный латышский или польский способ оформления фамилии. В русском языке такой суффикс редок, он чаще встречается в белорусской и западнославянской традиции, где мог указывать на уменьшительность или принадлежность.

Если отбросить вариант случайного искажения при записи, то Лудзенек — это «человек из Лудзы» или «живущий у Лудзы». Подобные фамилии (Лудзен, Лудзиньш) широко распространены в Латвии. Форма на -ек могла появиться при русификации: латышское окончание -с или -ш отсекалось, а вместо него добавляли уменьшительный славянский суффикс. В польском языке аналогичная модель дала бы фамилию Лудзенек или Лудзинек.

Написание через «дз» (а не через «з») — серьёзная подсказка. Оно передаёт латышское произношение, где сочетание «dz» читается как звонкий слитный звук [дз]. Это значит, что фамилию записывали со слуха, скорее всего, в XIX — начале XX века, когда носители переселялись из Прибалтики в центральные губернии Российской империи. Варианты «Лудзенек» и «Лудзенекс» могли сосуществовать, но в русских документах закрепился более короткий вариант.

Сословная принадлежность предков неясна, но в Латгалии фамилии на -ек носили как крестьяне, так и городские ремесленники. Поскольку Лудза — небольшой город, предок мог быть мещанином, торговцем или мастеровым, переехавшим в другую местность. Дворянского суффикса -ский здесь нет, что исключает шляхетское происхождение.

Единственная альтернативная версия — связь с личным именем. В некоторых говорах «лудза» или «лудзить» означало «льстить» или «обманывать», но это настолько редкое и локальное слово, что его привлечение выглядит натяжкой. Топонимическое объяснение надёжнее: фамилия Лудзенек — это метка о месте, которое носитель или его отец покинули, но сохранили в фамилии.