Фамилия Лукушкин образована от прозвища или имени Лукушка. Основа здесь — не «лук» как огородное растение, хотя такое народное объяснение тоже встречается. На самом деле Лукушка — это уменьшительная форма от канонического имени Лука (греч. «свет, светоч»). В русском быту имя Лука было распространено, и его ласкательные варианты давали начало множеству фамилий: Лукин, Лукашин, Лукашов, Лукушкин. Суффикс -к- в основе («Лукушк-») типичен для обиходных, домашних форм имени, а фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Лукушкин, то есть сын или потомок Лукушки.

Любопытно, что в некоторых говорах «лукушкой» называли и корзину из лыка или бересты — лукошко. Но вряд ли прозвище по предмету быта дало фамилию: в русской ономастике фамилии от названий утвари скорее исключение, чем правило. Версия с именем Лука надёжнее и подтверждается массой аналогичных фамилий (Ванюшкин, Петрушкин, Микушкин). Так что предки носителя фамилии, скорее всего, звались в быту Лукушкой — то есть были потомками человека по имени Лука.

Фамилия не относится к числу аристократических: суффикс -ин в сочетании с просторечной формой имени выдают крестьянское или мещанское происхождение. Встречается она в основном в центральных и северных областях России, где имя Лука было особенно популярно до XVIII века. В словарях фамилия фиксируется с XIX столетия, например, в переписях Вологодской и Костромской губерний попадаются крестьяне Лукушкины. Никаких громких исторических личностей с этой фамилией не известно — это рядовая, но выразительная русская фамилия, сохранившая память о старом имени.