Фамилия Лунюшкины — редкий пример, где за основу взято не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище Лунюшка. В его происхождении есть две основные версии, и обе уходят корнями в народные говоры и быт.

Первая версия связывает прозвище с диалектным глаголом «лунуть». В некоторых говорах он означает «выстрелить». Если следовать этой логике, Лунюшкой могли прозвать человека, который промышлял охотой, или, возможно, того, кто отличался меткостью. Вторая гипотеза ведет к названию птицы «лунь» — это хищник из семейства ястребиных, самец которого выделяется серовато-белым оперением. Прозвище могли дать за внешнее сходство, например, за светлые волосы или бледную кожу, либо за птичью повадку.

Важно и то, что Лунюшка могло быть не прозвищем, а мирским именем. До массового распространения христианских имен на Руси было принято называть детей в честь животных, растений или явлений природы. Считалось, что так ребенок получал покровительство природы и перенимал нужные черты — от той же птицы луня могли ждать зоркости или силы. В любом случае, именно от формы Лунюшка, а не напрямую от слова «лунь», и образована фамилия с помощью типичного суффикса принадлежности -ин, который указывал на родство: «чей?» — «Лунюшкин», то есть сын или потомок Лунюшки.

Фамилия эта — памятник не столько «славянской культуры» вообще, сколько конкретной диалектной и бытовой традиции северных и центральных областей России, где слово «лунуть» и названия птиц в основе прозвищ были особенно распространены. Однозначно сказать, какая из версий верна для конкретной ветви Лунюшкиных, можно только после анализа истории семьи и места ее проживания.