Фамилия Лушкикова — женская форма, а мужская, Лушкиков, образована с помощью типичного русского суффикса -ов. Это указывает на то, что в основе лежит прозвище или имя, принадлежавшее главе семьи. Вопрос только в том, что это за основа.

Самая прямая версия — от слова «лушка». В русских говорах «лушкой» называли небольшую ложку, а также меру сыпучих тел, что-то вроде совка. Прозвище Лушка мог получить либо человек, делавший ложки (ложкарь, резчик по дереву), либо тот, кто отличался какой-то бытовой привычкой — например, ел маленькой ложкой или, наоборот, зачерпывал ею «с верхом». В ономастике такие «бытовые» прозвища встречаются часто, и фамилия Лушкиков стоит в одном ряду с Ложкиными, Ковшовыми и Черпаковыми.

Вторая версия, менее очевидная, но не менее правдоподобная, — связь с именем Лука. Уменьшительная форма Лука — Лушка (через чередование к/ш: Лука — Лушка). Это характерно для народной речи: так же как Иван превращался в Ивашку, а Павел — в Пашку. В этом случае Лушкиков — буквально «потомок Лушки», то есть человека по имени Лука. Фамилии на -ушкин (-ушков) от канонических имён — массовое явление, и эта версия надёжнее, чем кажется на первый взгляд, потому что имя Лука было очень популярно в крестьянской среде.

Есть и третья, локальная версия, которую стоит упомянуть из-за её географической привязки. В некоторых областях «лушкой» называли лужу или болотистое место. Однако прозвище по такому признаку — «живущий у лушки» — обычно давало фамилию с суффиксом -ин (Лушкин) или -ский (Лушковский). Форма на -ов скорее указывает на принадлежность к конкретному лицу, а не к месту, поэтому эта версия слабее.

Таким образом, наиболее вероятно, что предок носителя фамилии Лушкиков был либо ремесленником-ложечником, либо носил имя Лука в его разговорной форме. Однозначно выбрать одну из двух версий без изучения конкретной семейной истории невозможно — обе укладываются в типичные модели русских фамилий.