Фамилия Лууенко — один из тех случаев, когда написание подсказывает путь к разгадке, а произношение может сбить с толку. Если вы слышите её впервые, скорее всего, решите, что корень здесь «лу-», как в слове «луна» или «лук». Но на деле фамилия образована от имени или прозвища Луй — редкой, но вполне реальной основы. В украинской и южнорусской традиции суффикс -енко (а точнее, его фонетический вариант -єнко) указывает на «малого», потомка: Лууенко — буквально «сын Луя» или «человек из рода Луя».

Само имя Луй — это, скорее всего, краткая форма от крестильного имени Лука (Лукий) или от Лукиан. В народе такие усечения были обычным делом: Лука превращался в Луй, а сын его становился Луенко. Однако двойное «у» в корне — редкая деталь. Скорее всего, это не опечатка, а следствие диалектного произношения или особенности записи в документах: в некоторых говорах ударный гласный могли растягивать, и в итоге на письме закрепилось двойное «у». Либо фамилия получила такое написание, чтобы отличить её от более распространённой формы Луенко.

Географически фамилия Лууенко тяготеет к украинским и пограничным русским областям — там, где суффикс -енко встречается чаще всего. В дореволюционных переписях она могла фиксироваться в вариантах Луенко, Луянко или даже Луйко — всё это однокоренные «родственники». Социально предки носителя фамилии были, вероятно, крестьянами или казаками, поскольку именно в этих слоях закрепилась модель образования фамилий по имени отца без добавления дворянских суффиксов.

Единственная сложность — двойное «у» делает фамилию похожей на финно-угорские заимствования (сравните с эстонской фамилией Луухт), но для русского ономастикона это маловероятно. Корень здесь славянский, а редкое написание — просто местная особенность, которая и отличает эту фамилию от десятков других Луенко.