Фамилия Луйко — один из тех случаев, когда на первый план выходит не суффикс, а сама основа, которая звучит непривычно для русского уха. Если не знать контекста, можно заподозрить что-то финно-угорское или балтийское, но на самом деле корень здесь славянский, хотя и диалектный.

В основе фамилии лежит глагол «луть» или «луить», который в некоторых южнорусских и украинских говорах означал «гнуть», «сгибать», «клонить». Отсюда же слово «лук» (оружие) — как согнутая ветка. Соответственно, прозвище Луйко могли дать человеку с характерной осанкой — сутулому, сгорбленному, либо тому, кто занимался изготовлением дуг, полозьев, коромысел — любых гнутых деревянных изделий. Вторая версия, менее вероятная, но тоже имеющая право на существование, связывает фамилию с диалектным «луя» — так в некоторых местах называли лужу или болотистое место. Тогда Луйко — человек, живущий у болота.

Модель образования типична для украинских и белорусских фамилий: суффикс -к-о указывает на прозвищное происхождение, часто с оттенком «сын такого-то» или «носитель признака». В русской традиции такие фамилии на -ко (Луйко, Гуйко, Буйко) обычно закрепились без изменений, в отличие от полонизированных вариантов на -ук/-юк.

Географически фамилия тяготеет к западным и юго-западным регионам бывшей Российской империи: её носители встречаются в исторических документах на территории современной Украины (особенно Волынь и Подолье), а также в Беларуси. В России фамилия редкая, встречается в основном на юге — в Краснодарском крае и Ростовской области, куда переселенцы принесли её в XIX–XX веках.

Сословная принадлежность предков Луйко, скорее всего, была крестьянской или казачьей. Никаких громких дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано, что косвенно подтверждает её «ремесленное» или прозвищное происхождение от человека с заметной внешностью или занятием.