Фамилия Лысуенко — редкий случай, когда основа почти наверняка указывает на внешность, а суффикс — на географию. Разбираем по порядку.

Корень здесь — «лыс-», то есть «лысый». Прозвище Лысый, Лыско на Руси давали не только человеку без волос. Часто так называли того, кто рано облысел, брил голову наголо (например, монах или казак) или просто имел светлую, «плешивую» голову. В некоторых говорах «лысый» означало также «белый, светлый» — например, о масти животного. Но основная версия — прозвище по приметной внешности.

Суффикс «-енко» — типичный украинский патронимический формант. Он означает «сын» или «потомок». Таким образом, Лысуенко — это буквально «сын Лысуя» или «сын Лысого». Форма Лысуй (с окончанием -уй) — это либо народный вариант прозвища Лысый, либо производное от него с уменьшительным или пренебрежительным оттенком. В украинской традиции такие фамилии на -енко массово закрепились в XVII–XVIII веках, особенно среди казачества и крестьян Левобережья и Слобожанщины.

Интересная деталь: в отличие от более частых Лысенко или Лысака, фамилия Лысуенко сохранила редкую переходную форму. Она показывает, что прозвище предка звучало не просто «Лысый», а именно «Лысуй» — такая модель встречается в старых украинских именованиях (ср. Грицуй, Иванчуй). Это делает фамилию более локальной, привязанной к конкретному говору.

Сословно, скорее всего, предки Лысуенко были казаками или крестьянами. Дворянских родов с такой фамилией в Российской империи не зафиксировано. Встречается она преимущественно в Украине и прилегающих областях России, где жили выходцы с Украины.

Коротко: фамилия образована от прозвища Лысуй (лысый человек) по украинской модели «сын такого-то». Никаких тайных смыслов — просто меткая характеристика родоначальника, закреплённая в фамилии.