Фамилия Люфате — редкий случай, когда при первом взгляде на написание неясно даже, какой язык считать исходным. С точки зрения русской ономастики, перед нами фамилия с конечным элементом -е, что совершенно нетипично для славянских моделей. В русском языке фамилии на -е почти не образуются: это либо застывшие формы родительного падежа (как в украинских фамилиях на -енко, но там другое), либо иноязычные заимствования. Скорее всего, Люфате — это русифицированная запись фамилии из языков Кавказа или тюркской группы.

Наиболее правдоподобная версия ведет к адыгским (черкесским) фамилиям. В адыгском языке есть фамилии, оканчивающиеся на -э (например, Хакурате, Шеуджен), где конечное -э — показатель определенности или часть основы. Основа «Люфа» (или «ЛIуфа») может восходить к адыгскому «лIу» — «мужчина, муж» и «фэ» — «цвет, масть», что в прозвищной форме могло означать «мужественный», «цвет мужества» или даже «красный муж» (если фэ понимать как красный цвет, символ воинской доблести). В таком случае предок носителя фамилии мог получить прозвище за храбрость или внешность.

Вторая версия — тюркская. В тюркских языках есть корень «люфат» (или «луфат») в значении «словарь, лексика» (от арабского лугат), но фамилия от такого книжного слова маловероятна. Более реалистично видеть здесь искаженное арабское имя или прозвище. Например, «Люфти» (одна из форм имени Лютфи — «добрый, милостивый») с добавлением аффикса принадлежности -е, что встречается в фамилиях крымских татар или народов Дагестана. Но написание Люфате ближе к адыгскому типу.

Поскольку фамилия крайне редкая, её география узкая. Встречается она преимущественно в Краснодарском крае и Адыгее, что подтверждает адыгскую версию происхождения. Сословно носители такой фамилии могли быть как князьями (в адыгском обществе были фамилии высшего сословия), так и свободными крестьянами-общинниками — без дополнительных генеалогических изысканий сказать точнее нельзя. В русских документах фамилия могла записываться на слух, отсюда и необычное окончание -е вместо более привычного -ов или -ев.