Фамилия Мафйдан — редкая и звучит не по-русски. Её происхождение почти наверняка иноязычное, и разгадка лежит не в славянской ономастике, а в тюркских или арабских корнях.

Самая вероятная версия связывает фамилию с арабским словом «мафйад» (مفيض), означающим «изливающий», «дающий в изобилии» или «источник». В тюркских языках, куда слово перекочевало, оно могло трансформироваться в «мафйдан» и использоваться как личное прозвище или имя. Человек, получивший такое прозвище, мог быть щедрым, гостеприимным или заниматься торговлей, связанной с водой или жидкостями (например, содержать родник или постоялый двор с колодцем). Суффикс -ан в конце часто указывает на тюркскую адаптацию арабских заимствований.

Вторая, менее вероятная гипотеза — что фамилия возникла от искажённого географического названия. Например, от города Майдан (Maidan) в Иране или от тюркского «майдан» — «площадь», «ровное место». В этом случае фамилия означала бы «уроженец такого-то места». Но форма «Мафйдан» с буквой «ф» вместо «й» в середине — скорее всего, результат записи на слух при переезде носителя в русскоязычную среду, когда исходное «Майдан» или «Мафьяд» записали как «Мафйдан».

Фамилия не имеет русских суффиксов (-ов, -ин), что говорит о её позднем закреплении в документах — скорее всего, в конце XIX — начале XX века, когда фиксировали фамилии выходцев из Закавказья, Средней Азии или Поволжья. Предки носителей фамилии могли быть татарами, азербайджанцами, турками или представителями других народов, испытавших влияние арабской культуры и языка. Встретить фамилию Мафйдан сегодня можно в регионах с тюркским населением — в Татарстане, Башкортостане, на Северном Кавказе, а также среди потомков эмигрантов.