Фамилия Магеденюк — редкий случай, когда сразу понятна география, но неочевидна основа. Суффикс -юк однозначно указывает на западноукраинское, скорее всего волынское или подольское, происхождение. В тех краях -юк (как и -чук) — типичный патронимический формант: «сын такого-то» или «потомок такого-то». То есть Магеденюк — это «сын Магедена». А вот откуда взялся сам Магеден — вопрос.

Самая вероятная версия ведёт к библейскому имени Магедон (или Магеддо). В Ветхом Завете это название города, но в славянской традиции оно иногда переходило в личные имена. В украинских говорах Магедон могло сократиться до Магеден, а потом обрасти суффиксом. Менее убедительная гипотеза — от польского magdać się (суетиться, копошиться), но тогда фамилия звучала бы иначе, с другим ударением и окончанием.

Важно, что фамилия не крестьянская в привычном смысле. В Западной Украине патронимы на -юк в XIX веке часто давали не просто по отцу, а по прозвищу или имени деда, которое уже успело закрепиться. Магеденюк — не из частотных, носителей немного, и они почти все из Волынской или Ровенской областей. Это говорит о том, что род был локальным, возможно, одной ветви.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Магедов, Магедович — показывает, что основа Магед- встречается и в еврейской среде (от имени Маген, «щит»), но суффикс -юк в таком контексте нетипичен. Скорее всего, перед нами христианское, украинское образование от редкого личного имени или прозвища, которое не сохранилось в документах.