Фамилия Махилейт — редкий случай, когда происхождение приходится искать не в славянских землях, а в немецкой или еврейской (ашкеназской) среде. Её основа — личное имя или прозвище, а окончание -ейт выдаёт характерный суффикс, который в немецком языке часто оформлял фамилии жителей Восточной Пруссии, Прибалтики или выходцев из немецких колоний в Российской империи.

Корень Махил- восходит к древнееврейскому имени Махир (Machir), что означает «торговец» или «продавец». В Ветхом Завете это имя носил сын Манассии, родоначальник одного из колен Израилевых. Однако в немецком произношении имя могло трансформироваться: через стадии Machiel, Machill к форме с суффиксом -eit, который указывал на принадлежность или происхождение (сравните фамилии типа Либерман — Либерманн, где -манн — «человек», а -ейт — более редкий, но встречающийся в остзейских фамилиях вариант). Таким образом, Махилейт буквально могло означать «потомок Махира» или «человек из рода Махиров».

Возможна и вторая, более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть как прозвище от немецкого диалектного слова, связанного с глаголом machen («делать, мастерить»), но с искажённым окончанием. В таком случае Махилейт — это «мастеровой», «ремесленник», но эта гипотеза менее убедительна: суффикс -eit нехарактерен для немецких профессиональных прозвищ, которые обычно заканчиваются на -er (Macher, Schuster).

Географически фамилия почти не встречается в России, за исключением единичных записей в метрических книгах лютеранских приходов Санкт-Петербурга и Поволжья (немецкие колонии). В современной Германии она тоже редка. Социальный контекст: носители фамилии, скорее всего, были мещанами или ремесленниками, а не дворянами, поскольку немецкие фамилии на -eit редко фиксировались в родословных книгах Российской империи.

Если отбросить сомнительные версии, наиболее правдоподобной остаётся библейская основа: фамилия Махилейт — это германизированная форма еврейского патронима, которую предок получил при переселении в немецкоязычную среду или при записи в метрические книги.