Фамилия Махлумова — редкий случай, когда разбор упирается не в славянский корень, а в арабское заимствование. Основа «махлум» восходит к арабскому «махлум» (مَحْلُوم), что значит «лишённый», «обездоленный», «лишённый наследства» или «отлучённый». В исламской и тюркской среде это слово могло быть прозвищем для человека, потерявшего имущество, родственные связи или социальный статус, — такая характеристика легко закреплялась в качестве родового имени.

Фамилия образована по русской патронимической модели с суффиксом -ов, типичным для фамилий, возникших в среде, где русское делопроизводство и православие соседствовали с тюркскими и арабо-персидскими именами. Суффикс -а (Махлумова) указывает на женскую форму, но сама фамилия могла быть зафиксирована у мужчин как Махлумов. Встречаемость фамилии крайне низкая, и её география — преимущественно регионы Северного Кавказа (Дагестан, Чечня, Ингушетия) и Поволжье (Татарстан, Башкортостан), где исламская культура смешивалась с русским административным учётом.

Интересно, что в отличие от более частых фамилий на -ов от тюркских основ (например, Абдулов, Набиев), Махлумова сохранила не имя пророка или почётный титул, а социально-бытовое прозвище. Это говорит о том, что предок носителя мог быть не из знатного рода, а из обедневшей или переселившейся семьи, где прозвище «обездоленный» стало фамильным. В словарях тюркских и арабских заимствований (например, у В. В. Радлова или в «Этимологическом словаре тюркских языков» Э. В. Севортяна) слово «махлум» встречается в значении «лишённый», но в ономастических справочниках фамилия почти не описана — это редкий случай, когда семейная история читается прямо из корня.