Фамилия Махопип — редкая и нестандартная для русского уха, и её происхождение, скорее всего, не связано с привычной моделью «от имени или прозвища + суффикс». В ней нет ни одного из типичных фамильных суффиксов (-ов, -ин, -ский, -их), что сразу указывает на искусственное или позднее происхождение, либо на заимствование из языка, где такие суффиксы не нужны.

Первое, что приходит в голову — фамилия могла быть образована как сложное слово, например, из двух основ: «махо» и «пип». «Махо» в русских говорах может быть связано с глаголом «махать» (быстрый, размашистый человек) или с диалектным «махонький» (маленький). Вторая часть — «пип» — звучит как звукоподражание (писк, пип-пип) или как искажённое «пипка» (трубка, наконечник). Вместе это могло быть шуточным или профессиональным прозвищем: например, «маленький пискун» или «тот, кто машет дудкой».

Но есть и другая, более вероятная версия: фамилия — результат искажения или переосмысления при переписи. В XIX веке крестьянам, не имевшим фамилий, часто давали их по случайному признаку, по названию деревни или даже по ошибке писаря. Махопип могло возникнуть из фамилии Махопёров (от «махать пером» — писарь) или из прозвища Махопуп (от «пуп» — коротышка, что в говорах звучало как «пуп»). Буква «п» на конце вместо «в» или «б» — типичная описка или диалектная замена.

Географически такая фамилия могла закрепиться в регионах, где были сильны украинские или белорусские говоры, где конечные согласные часто оглушаются и смешиваются. Встретить её сегодня — большая редкость, и носитель, скорее всего, имеет предков, получивших фамилию по случайному стечению обстоятельств, а не по роду занятий или личному качеству.