Фамилия Макинзон — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет совершенно нерусскую основу. В ней сразу бросается в глаза нехарактерный для славянских фамилий суффикс -зон. Этот суффикс — верный признак того, что перед нами фамилия еврейского происхождения, образованная по ашкеназской (восточноевропейской) модели.

В основе фамилии лежит мужское имя Макин. В еврейской традиции Макин — это форма имени Менахем, которое означает «утешитель». Суффикс -зон (или -сон) в ашкеназских фамилиях выполняет ту же роль, что и русские суффиксы -ов или -ин: он образует патроним, то есть указывает на отца. Таким образом, Макинзон — это буквально «сын Макина» (Менахема). Фамилия сложилась в среде евреев-ашкеназов, которые в XVIII–XIX веках на территориях Российской империи и Австро-Венгрии массово получали фамилии по отцу или по профессии.

Интересно, что в русском языке эта фамилия могла бы выглядеть как Макинин или Макинов, если бы её адаптировали по обычным правилам. Но суффикс -зон сохранился в исходном виде, что делает фамилию Макинзон «говорящим» маркером своего происхождения. Географически фамилия тяготеет к западным губерниям Российской империи — территориям современной Беларуси, Украины и Польши, где компактно проживали еврейские общины.

Встречаются и варианты написания — Макинсон, Макензон. Разница в написании объясняется особенностями записи на слух при оформлении документов в XIX веке: чиновники не всегда точно передавали иноязычные звуки, поэтому одна и та же фамилия могла закрепиться в разных формах.