Фамилия Маковски может ввести в заблуждение своим польским окончанием, но её корни, скорее всего, чисто русские, церковные. Самая правдоподобная версия происхождения связана не с народом или географией, а с календарём — праздником Спас-Маккавей, который отмечают в начале августа. В народе этот день называли просто Маковей или Маковеи, отсюда и пошло прозвище человека, родившегося или крещёного в эту дату. Прозвище Маковей легко превратилось в отчество, а затем и в фамилию Маковски — по типичной модели на -ский, указывающей на принадлежность.

Менее убедительная гипотеза выводит фамилию напрямую от библейского народа маккавеи, героев Ветхого Завета. Семинарское происхождение, то есть искусственное создание фамилии в духовных училищах, тоже возможно, но праздничная версия выглядит естественнее: она объясняет, почему фамилия бытовала не только среди священников, но и у крестьян.

В русском языке фамилия закрепилась в форме Маковский — с ударением на второй слог. Вариант Маковски с окончанием -и — это либо полонизированная запись (по образцу польских фамилий), либо результат поздней паспортизации, когда переписчики на слух фиксировали говор. В любом случае, перед нами не редкая искусственная конструкция, а фамилия, родившаяся из народного названия церковного праздника.