Фамилия Малбакова — женская форма фамилии Малбаков. Её основа восходит к прозвищу или имени, образованному от тюркского корня «мал» (скот, имущество, богатство). В карачаево-балкарском, кумыкском и других тюркских языках слово «мал» означает не только домашних животных, но и достаток в целом. Вторая часть — «бак» — может быть как самостоятельным словом (например, «смотри», «береги» в тюркских языках), так и частью сложного имени-оберега.

Наиболее вероятное объяснение: «Малбак» — составное прозвище, которое можно перевести как «богатство смотри» или «береги скот». Такие имена-пожелания давали детям, чтобы уберечь их от сглаза или бедности. Встречается и другая версия: «мал» могло быть частью арабского имени (Малик — «владыка»), но для фамилии Малбакова это менее характерно, так как суффикс «-бак» не типичен для арабских заимствований.

Фамилия распространена преимущественно на Северном Кавказе, особенно среди карачаевцев и балкарцев. В этих культурах фамилии с компонентом «мал» нередко указывали на занятие предков: скотоводство было основой хозяйства. В отличие от русских фамилий на -ов, которые обычно образуются от отчества, здесь суффикс -ов присоединился к тюркской основе в процессе русификации документов в XIX–XX веках.

Однокоренные фамилии — Малбаев, Малбиев, Малбахов — различаются суффиксами, но все они связаны с тюркским «мал». В фамилии Малбакова суффикс «-бак» встречается реже, чем «-бай» или «-бий», что делает её более локальной и специфичной для определённых родов. Точных сведений о сословной принадлежности носителей нет, но, как правило, такие фамилии носили свободные общинники, а не князья или рабы.