Фамилия Малирян — характерный пример армянской модели фамилии с суффиксом -ян, который на русской почве часто закреплялся в форме -ян (а не -янц). Этот суффикс указывал на родство: «из дома такого-то», «принадлежащий к роду». В армянской ономастике фамилии на -ян (исторически -янц) массово сложились в XIX веке, когда фиксация фамилий стала обязательной, но основа могла быть гораздо старше.

Основа «Малир» неочевидна и допускает две версии. Первая: от армянского имени или прозвища Малир, которое могло быть вариантом имени Малер (от «мал» — «овца» или «баран»). В таком случае фамилия восходит к занятию скотоводством или к прозвищу пастуха. Вторая, более вероятная: от тюркского корня, вошедшего в армянскую речь. В тюркских языках «малыр» (или «малы») означает «скот», «домашнее животное», и прозвище Малир мог получить владелец скота или человек, торгующий скотом. Это характерно для армян, живших в смешанной с тюрками среде Восточной Армении (современная Армения, Нахичевань, Карабах).

Словообразовательная модель проста: к основе Малир добавляется фамильный суффикс -ян. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Малиря́н, как в большинстве армянских фамилий. Географически фамилия встречается в Армении, а также в армянских диаспорах России и стран бывшего СССР. В России носители фамилии Малирян чаще всего сосредоточены в Краснодарском крае, Ставрополье и Ростовской области — регионах, куда армяне переселялись в XIX–XX веках.

Редкость фамилии в том, что она не имеет прямого аналога в русской ономастике — там нет фамилий на -ян, а основа Малир не встречается в славянских прозвищах. Это сразу указывает на армянское происхождение. Если сравнивать с однокоренными, то ближе всего фамилия Малерян (от того же корня, но с другим суффиксом), а также распространенная Малян (от «мал» — скот). Малирян — более редкий вариант, возможно, локальный, закрепившийся в конкретном роду.