Фамилия Малофушина — редкий пример, где почти каждый слог ставит перед исследователем загадку. Начнём с того, что перед нами, скорее всего, женская форма фамилии (Малофушин), а не исходная мужская. Сама основа «Малофуш-» не встречается в распространённых списках русских фамилий, что указывает на её локальное или очень узкое происхождение.

Первый и самый вероятный путь — искажение или народная переделка редкого имени. В русских говорах имя Малафей (от греческого «благочестивый») нередко звучало как Малофей, а в уменьшительной форме — Малофуша, Малофушка. Сравните: Феофан превращался в Фофан и Фофанов, а Елевферий — в Алфёр и Алфёров. По этой логике, Малофушин — «сын Малофуши», то есть потомок человека, которого в быту звали Малофуша. Суффикс -ин указывает на принадлежность: чей? — Малофушин.

Вторая версия, менее изящная, но тоже имеющая право на существование, — прозвище, сложенное из двух корней: «мало» и «фуша». Слово «фуша» в диалектах может означать нечто надутое, пустое, либо быть звукоподражанием (пыхтеть, фыркать). Тогда Малофуша — человек, который «мало пыхтит», то есть медлительный, либо, наоборот, тот, кто «мало весит» (малорослый, худой). Однако эта версия слабее: прозвища с частицей «мало-» встречаются (Малобесов, Малодумов), но обычно они более прозрачны по второму корню.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где имя Малафей было особенно популярно. Встречается она крайне редко, и её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких соседних сёл. Сословный состав предков определить трудно, но форма на -ин типична для крестьянской и мещанской среды, а не для дворянства.

Таким образом, основная гипотеза: Малофушина — это «дочь или жена Малофуши», где Малофуша — разговорная форма крестильного имени Малафей. Фамилия сохранила живую народную фонетику и не прошла через официальную книжную обработку, что делает её ценным свидетельством деревенского словообразования XIX века.